港航、港口码头水工资料员的核心职责是负责港航及港口码头水工工程项目的资料收集、整理、归档、报审与管理，确保工程资料的完整性、准确性、规范性和时效性，为工程施工、验收、竣工及后续运维提供完整的数据支撑。